22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1170 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1170  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  270  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0643  hypothetical protein  92.97 
 
 
128 aa  256  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3609  hypothetical protein  45.9 
 
 
142 aa  114  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.68702  hitchhiker  0.000160663 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  31.01 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
138 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1075  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.19 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1689  thioesterase family protein  32.06 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2201  thioesterase superfamily protein  32.22 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  32.06 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1543  thioesterase family protein  32.48 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0104  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
142 aa  50.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0454736  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  30.58 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0158  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  31.25 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1366  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  27.93 
 
 
145 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  27.03 
 
 
145 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  26.61 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>