238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2083 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  313  6e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  62.07 
 
 		 160 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  65.22 
 
 		 158 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  65.22 
 
 		 158 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  63.51 
 
 		 167 aa  189  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  53.79 
 
 		 193 aa  151  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  52.41 
 
 		 185 aa  143  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  54.48 
 
 		 182 aa  143  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  51.72 
 
 		 204 aa  140  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  47.97 
 
 		 187 aa  136  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  51.49 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  47.59 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  45.39 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  44.83 
 
 		 189 aa  120  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  44.52 
 
 		 179 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  45.89 
 
 		 189 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  44.9 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  43.36 
 
 		 158 aa  116  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  47.65 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  37.59 
 
 		 142 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  44.2 
 
 		 176 aa  110  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  41.26 
 
 		 191 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  45.93 
 
 		 181 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  37.59 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  42.66 
 
 		 225 aa  106  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  41.73 
 
 		 183 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  39.04 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  38.03 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  43.84 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  39.01 
 
 		 161 aa  103  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  35.21 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  40.85 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  40.94 
 
 		 176 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  40.94 
 
 		 176 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 170 aa  97.1  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  42.52 
 
 		 174 aa  97.1  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  37.68 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  38.69 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  38.69 
 
 		 144 aa  95.5  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  36.96 
 
 		 145 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  36.96 
 
 		 145 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  36.96 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 		 146 aa  92  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  37.68 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  36.23 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  36.23 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  40.56 
 
 		 209 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  39.01 
 
 		 191 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  37.68 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  37.68 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 232 aa  80.5  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  37.68 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  37.68 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  37.68 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  38.52 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  38.76 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  42.02 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  36.96 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  39.39 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  36.28 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  37.89 
 
 		 182 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  42.18 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  31.33 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  32.52 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  32.31 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  32.31 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  29.5 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  34.09 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  32.31 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  39.13 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  29.85 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  39.13 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  31.29 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  31.3 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  31.3 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  31.3 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  33.91 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  28.67 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  39.6 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0316  hypothetical protein  28.78 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  34.68 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  39.13 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>