More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1736 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  273  8e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  99.26 
 
 
135 aa  271  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  50.45 
 
 
151 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  43.41 
 
 
140 aa  120  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4877  thioesterase superfamily protein  48.21 
 
 
156 aa  103  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 
159 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  44.26 
 
 
152 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 
161 aa  97.1  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  45.08 
 
 
152 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  41.82 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  38.84 
 
 
153 aa  84  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  40.19 
 
 
142 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  40.17 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  40.95 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  40.95 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  40.95 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  36.44 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  42.61 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  34.65 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  43.93 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  32 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1683  thioesterase superfamily protein  36.54 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.083684  normal  0.174772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  35.59 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  39.62 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  34.06 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  33.61 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  33.61 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2042  hypothetical protein  34.75 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  33.86 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  34.34 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  35.34 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  35.29 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  38.6 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  34.65 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  35.34 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  33.82 
 
 
204 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  35.34 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  33.86 
 
 
134 aa  67  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  33.86 
 
 
134 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  33.86 
 
 
134 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  33.86 
 
 
134 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  35.85 
 
 
134 aa  67  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  36.19 
 
 
145 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  35.92 
 
 
148 aa  67  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  36.19 
 
 
145 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  35.34 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  33.05 
 
 
161 aa  67  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  35.34 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  35.34 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  35.24 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  34.96 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  38.78 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  30.37 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  33.61 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  34.13 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  30.33 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  36.19 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  30.88 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  34.48 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0117  thioesterase superfamily protein  38.6 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0110  phenylacetic acid degradation-related protein  37.25 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 
182 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  26.52 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  35.92 
 
 
165 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 
182 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 
128 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  35.29 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  31.31 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  32.82 
 
 
185 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  31.4 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 
232 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>