164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4425 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 
134 aa  271  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  98.51 
 
 
134 aa  268  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  88.06 
 
 
134 aa  243  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  78.95 
 
 
134 aa  223  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  77.44 
 
 
134 aa  221  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  77.44 
 
 
134 aa  221  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  77.44 
 
 
134 aa  221  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  77.44 
 
 
134 aa  221  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  78.03 
 
 
153 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  76.69 
 
 
134 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  76.69 
 
 
134 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  76.69 
 
 
134 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  76.69 
 
 
153 aa  216  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  79.37 
 
 
126 aa  215  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  79.37 
 
 
126 aa  215  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  79.37 
 
 
126 aa  215  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  74.44 
 
 
134 aa  213  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  74.44 
 
 
134 aa  213  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  66.13 
 
 
138 aa  167  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  62.79 
 
 
141 aa  166  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  43.18 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1023  thioesterase superfamily protein  42.61 
 
 
154 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.42478  normal  0.0264332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1959  thioesterase superfamily protein  47.5 
 
 
139 aa  103  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  40.44 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 
154 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  37.5 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  32.33 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  35.94 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  38.68 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  39.62 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  35.85 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  35.85 
 
 
135 aa  67  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  34.33 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  40.57 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  37.74 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  37.72 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  37.38 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  38.68 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  30.89 
 
 
129 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  32.38 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  37.5 
 
 
151 aa  58.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 
191 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  37.96 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  37.96 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  30.08 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  36.76 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
169 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  37.08 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  35.78 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  33.01 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  35.23 
 
 
137 aa  53.5  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11565  hypothetical protein  27.27 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  34.86 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  27.64 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  35.45 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  32.12 
 
 
140 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 
127 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0327  hypothetical protein  26.32 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000150784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  24.58 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  32.97 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  28.33 
 
 
209 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  24.14 
 
 
149 aa  50.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  27.52 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 
146 aa  50.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0829  hypothetical protein  26.5 
 
 
138 aa  50.1  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  36.27 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  36.46 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3834  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3529  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  30.19 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  26.61 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  36.36 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  34.41 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  26.67 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  30.84 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2153  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446608  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2713  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
128 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 
160 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>