75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3094 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  100 
 
 
139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  70.99 
 
 
151 aa  194  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  65.65 
 
 
137 aa  187  5.999999999999999e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  63.7 
 
 
138 aa  186  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  61.54 
 
 
138 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  62.31 
 
 
138 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  65.65 
 
 
137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  56.06 
 
 
141 aa  144  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  52.17 
 
 
145 aa  136  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  51.91 
 
 
142 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  48.89 
 
 
142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  48.89 
 
 
142 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  50.38 
 
 
143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  49.24 
 
 
142 aa  126  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  47.06 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  47.41 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  52.55 
 
 
169 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  44.78 
 
 
135 aa  120  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  46.32 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  42.65 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  47.69 
 
 
140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  42.42 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2418  thioesterase superfamily protein  50.36 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2713  thioesterase superfamily protein  51.11 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  47.33 
 
 
156 aa  110  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2490  thioesterase superfamily protein  50.37 
 
 
149 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  49.28 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3834  hypothetical protein  49.19 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5730  thioesterase superfamily protein  44.62 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3529  hypothetical protein  49.19 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  40.71 
 
 
147 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  41.61 
 
 
147 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  47.14 
 
 
145 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  46.43 
 
 
135 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  43.75 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  48.09 
 
 
148 aa  94  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  47.33 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1283  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  39.64 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  35.48 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  37.08 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
134 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  36.36 
 
 
134 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  36.36 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  36.36 
 
 
134 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  37.08 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  34.09 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  34.09 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  34.09 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  34.09 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  34.09 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  34.09 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  34.09 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  36.36 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  37.63 
 
 
134 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  39.47 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 
154 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  34.94 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04930  hypothetical protein  33.04 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
304 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  32.26 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  32 
 
 
319 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  27.91 
 
 
295 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  35.63 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  30.33 
 
 
193 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>