95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4342 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
169 aa  339  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  59.42 
 
 
156 aa  160  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  58.27 
 
 
145 aa  155  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  55.07 
 
 
147 aa  151  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  59.71 
 
 
142 aa  150  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2713  thioesterase superfamily protein  58.09 
 
 
143 aa  147  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2490  thioesterase superfamily protein  58.09 
 
 
149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  59.42 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2418  thioesterase superfamily protein  58.09 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  58.99 
 
 
142 aa  144  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  58.7 
 
 
142 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  57.25 
 
 
142 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  58.7 
 
 
148 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  59.42 
 
 
138 aa  138  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  57.25 
 
 
142 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  57.97 
 
 
148 aa  137  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  56.52 
 
 
142 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  54.41 
 
 
140 aa  135  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  54.07 
 
 
137 aa  134  8e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  54.14 
 
 
151 aa  130  7.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  52.14 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  55.64 
 
 
138 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  54.89 
 
 
138 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  51.8 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  54.55 
 
 
141 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5730  thioesterase superfamily protein  50.36 
 
 
152 aa  125  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  46.15 
 
 
147 aa  125  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  55.4 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  52.55 
 
 
139 aa  125  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  55.8 
 
 
145 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  53.38 
 
 
137 aa  120  8e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  47.48 
 
 
140 aa  117  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3529  hypothetical protein  53.23 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3834  hypothetical protein  53.23 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  46.56 
 
 
140 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  42.65 
 
 
135 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  44.12 
 
 
135 aa  104  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  41.18 
 
 
135 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 
143 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1283  thioesterase superfamily protein  41.48 
 
 
147 aa  101  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  52.17 
 
 
137 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
150 aa  82  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
127 aa  58.9  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 
149 aa  57.8  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  32.41 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  31.68 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  32.41 
 
 
134 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  28.97 
 
 
153 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 
134 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  28.97 
 
 
134 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  28.97 
 
 
134 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  28.97 
 
 
134 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 
134 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  32 
 
 
141 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  27.1 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  27.1 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  27.1 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  27.1 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  27.1 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  27.1 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  27.1 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  28.04 
 
 
134 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 
131 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  27.72 
 
 
146 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
135 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  32.97 
 
 
134 aa  48.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
148 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  35.05 
 
 
144 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
128 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  33.67 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  36.73 
 
 
144 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0829  hypothetical protein  27.52 
 
 
138 aa  45.1  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04930  hypothetical protein  34.15 
 
 
145 aa  45.1  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.28 
 
 
153 aa  44.7  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  24.8 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  34.58 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  27.66 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3025  thioesterase superfamily protein  31.96 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0281155  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  31.63 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  32.89 
 
 
135 aa  42  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  32.89 
 
 
135 aa  42  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  28.89 
 
 
138 aa  40.8  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
191 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2049  phenylacetic acid degradation-related protein  27.27 
 
 
135 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2095  hypothetical protein  27.27 
 
 
128 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117378  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  27.27 
 
 
128 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0048  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.21 
 
 
124 aa  40.8  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979137 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>