More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2942 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
135 aa  275  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  39.83 
 
 
153 aa  92  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  35.61 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  34.17 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  30.43 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  28.81 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  28.81 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  28.81 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  27.12 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  27.12 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  27.12 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  27.12 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  27.12 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  27.12 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  27.12 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  41.76 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  27.97 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  30.16 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  32.79 
 
 
148 aa  67  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  29.41 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  26.27 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  29.91 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  29.41 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  30.65 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  30.43 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  30.3 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  29.23 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  30.65 
 
 
127 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  30.16 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  31.3 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  31.88 
 
 
209 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  30.3 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  29.77 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  29.01 
 
 
136 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 
127 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 
150 aa  60.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  34.07 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  30.84 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  32.23 
 
 
154 aa  58.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  30.16 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  35.63 
 
 
191 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
191 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  30.16 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  30.16 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  31.97 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  30.95 
 
 
238 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  30.53 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  27.13 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  34 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  34 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  30.53 
 
 
177 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  30.53 
 
 
177 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  30.53 
 
 
177 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  31.4 
 
 
176 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.4 
 
 
176 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  31.9 
 
 
374 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  30.95 
 
 
248 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
166 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 
165 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  30.89 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  29.57 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  25.64 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  25.41 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3202  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
181 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>