More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2253 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 147 aa  300  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  35.14 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  38.26 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  39.64 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  36.44 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  40.62 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  35.96 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  30.71 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  33.59 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 151 aa  70.1  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  33.59 
 
 		 185 aa  70.5  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  35.56 
 
 		 159 aa  70.1  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  37.61 
 
 		 159 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  36.28 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  34.17 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  36.75 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  36.75 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  36.28 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  37.7 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  36.75 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  36.75 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  36.75 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  36.75 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  36.75 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  36.75 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  36.75 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 		 159 aa  67  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  31.62 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  35.9 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  31.11 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  31.01 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  34.35 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  34.21 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  36.67 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  37.25 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  40.22 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  30.89 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  32.59 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 179 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  33.03 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  32.48 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  31 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  38.05 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  35.45 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  36.89 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  29.77 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  34.23 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  31.82 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  36.54 
 
 		 145 aa  62  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  34.86 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  35.58 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  35.58 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  35.58 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  35.58 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  35.58 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  36.36 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  35.58 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  34.82 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  35.96 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  32.59 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  29.1 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  35.58 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>