231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0970 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 160 aa  332  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  48.06 
 
 		 144 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  48.06 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  50 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  47.29 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  49.23 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  45.39 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  46.83 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  45.8 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  46.03 
 
 		 159 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  46.03 
 
 		 159 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  45.24 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  48.33 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  45.24 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  45.24 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  44.44 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  49.62 
 
 		 149 aa  120  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  45.83 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  46.56 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  46.56 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  46.56 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  46.56 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  46.56 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  46.56 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  46.56 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  45.8 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  44.2 
 
 		 143 aa  118  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  43.8 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  46.15 
 
 		 147 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  44.63 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  41.09 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 		 144 aa  90.5  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 		 137 aa  90.1  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  33.88 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 144 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  38.52 
 
 		 135 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  32.23 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  36 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  32.09 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  35.45 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  31.68 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  33.65 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  29.91 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  27.74 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  41.33 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0879  thioesterase superfamily protein  65.71 
 
 		 38 aa  58.5  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.92963 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  29.6 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  36.71 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  27.14 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  28.23 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 181 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 127 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  29.82 
 
 		 128 aa  52.4  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  37.08 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  29.77 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  24.34 
 
 		 154 aa  51.6  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  35.96 
 
 		 129 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 141 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 		 191 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 181 aa  50.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  24.34 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  24.34 
 
 		 154 aa  50.8  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  24.34 
 
 		 154 aa  50.8  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  25.66 
 
 		 154 aa  50.8  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  24.34 
 
 		 154 aa  50.8  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  24.34 
 
 		 154 aa  50.8  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>