More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5767 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 144 aa  288  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  50 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  45.76 
 
 		 139 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  40.74 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  42.98 
 
 		 165 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  40.8 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  45.83 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  43.1 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  43.59 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  45.3 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  40.65 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  45.3 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  46.15 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  40 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  40.68 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  41.03 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  40 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  40.65 
 
 		 159 aa  90.5  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 		 144 aa  90.1  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 		 160 aa  90.5  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  43.22 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  40.5 
 
 		 160 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  40.5 
 
 		 160 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  40.5 
 
 		 160 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  40.5 
 
 		 160 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  40.5 
 
 		 160 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  40.5 
 
 		 160 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  40.5 
 
 		 160 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  40 
 
 		 176 aa  88.2  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  39.37 
 
 		 154 aa  87.8  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  41.94 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  39.67 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  41.38 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  42.97 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  40.8 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  44.44 
 
 		 146 aa  83.6  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  46.81 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  39.66 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  43.62 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  43.62 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  35.34 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  36.04 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  38.95 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  31.9 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  31.09 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  30.97 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  33.62 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  37.62 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  30.09 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  38.14 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  35.09 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  34.23 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  37.11 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.43 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0110  phenylacetic acid degradation-related protein  33.06 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11565  hypothetical protein  31.09 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  31.93 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  35.79 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  29.82 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  29.91 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 232 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.78 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  34.4 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  35.2 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1510  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.86 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269892  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  34.03 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  35.78 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  35.04 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  34.4 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  34.4 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  31.62 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>