More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2878 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  317  6e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  63.71 
 
 
138 aa  169  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  53.33 
 
 
141 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  51.85 
 
 
157 aa  148  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  55.38 
 
 
144 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  53.03 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  53.03 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  53.03 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  53.03 
 
 
248 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  53.08 
 
 
147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  53.03 
 
 
238 aa  137  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  50.7 
 
 
147 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  50.7 
 
 
147 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  50.7 
 
 
147 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  50.7 
 
 
147 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  54.55 
 
 
152 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  53.03 
 
 
374 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  52.31 
 
 
144 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  51.41 
 
 
147 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  48.59 
 
 
147 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  48.59 
 
 
147 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  52.67 
 
 
136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  47.83 
 
 
148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  54.03 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  49.59 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  42.96 
 
 
153 aa  104  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 
155 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  45.45 
 
 
132 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  44 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 
162 aa  97.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  44.62 
 
 
153 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  44.53 
 
 
213 aa  97.1  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  41.46 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  41.09 
 
 
126 aa  88.6  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  37.86 
 
 
151 aa  88.2  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  43.94 
 
 
155 aa  86.3  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  35.14 
 
 
153 aa  85.1  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 
169 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  36.51 
 
 
140 aa  84  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2571  hypothetical protein  60.29 
 
 
99 aa  83.6  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163005  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  41.94 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  38.06 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  35.2 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  32.39 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  32.39 
 
 
151 aa  79  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  32.39 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  38.67 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  32.86 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  34.88 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  36 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  38.06 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  34.04 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  35.88 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4384  hypothetical protein  39.34 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.359887  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  34.65 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  37.4 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  37.7 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  36.51 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  39.67 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  36.51 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  36.51 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  36.51 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  36.51 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  36.51 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  36.51 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  36.51 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  38.14 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  37.4 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  39.5 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  36.36 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  36.36 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 
134 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  34.29 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  36.44 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  34.06 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  38.14 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  33 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1582  phenylacetic acid degradation-like protein  35.54 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000511967  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  30 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 
144 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  37.25 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 
127 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  31 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  32.85 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  37.7 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
148 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  35 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.371406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>