More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3656 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 127 aa  251  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  42.73 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  35.29 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  36.13 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  36.13 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  36.44 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  36.44 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  38.79 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  35.29 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  37.07 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  35.29 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  35.29 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  40.17 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  42.11 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  34.45 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  34.45 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  34.45 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  34.45 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  34.45 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  34.45 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  34.45 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  37.4 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  36.72 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  35.04 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  28.45 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  38.64 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  37.17 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  37.74 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  30.97 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  30.08 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  31.93 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  34.17 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  38.79 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  36.79 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  42.7 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  31.58 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  30.65 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  32.17 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  33 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  32.74 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  31.93 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  32.23 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  32.5 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  36 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  34.71 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  32.17 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  39.29 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  26.5 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  31.4 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  34.43 
 
 		 209 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  26.5 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4877  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  41.11 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  41.11 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  29.41 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  38.6 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  29.63 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>