64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0110 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0110  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 160 aa  325  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2825  thioesterase superfamily protein  76.76 
 
 		 151 aa  220  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249346  normal  0.0935289 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0327  hypothetical protein  41.43 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000150784  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  37.25 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  37.25 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3265  hypothetical protein  29.66 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  32.41 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  28.47 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  29.91 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  30.34 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  31.25 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  25.45 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  28.7 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  25.21 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  21.8 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 		 137 aa  48.5  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  30.21 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 150 aa  47.4  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  30 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  27.27 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  26.85 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  30.08 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  28.35 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  28.35 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  27.18 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 122 aa  43.9  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  26.32 
 
 		 149 aa  43.9  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  34.52 
 
 		 142 aa  43.9  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  25.25 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  26.4 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  27.88 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  33.98 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  26.5 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  27.83 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  29.59 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  29.59 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  25.49 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  22.22 
 
 		 138 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  26.67 
 
 		 161 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  26.23 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  24.24 
 
 		 136 aa  42  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  24.75 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1977  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 184 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 		 135 aa  41.2  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  26.8 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 176 aa  41.2  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  21.67 
 
 		 168 aa  40.8  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  24.58 
 
 		 146 aa  40.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>