278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1855 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 154 aa  313  7e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  64.24 
 
 		 176 aa  189  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  59.85 
 
 		 143 aa  161  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  63.08 
 
 		 146 aa  159  9e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  58.59 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  51.32 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  57.78 
 
 		 147 aa  144  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  57.6 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  56.72 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  54.14 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  55.38 
 
 		 135 aa  141  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  46.92 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 		 144 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  47.69 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  45.77 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  46.67 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  46.67 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  48.25 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  48.25 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  48.25 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  48.25 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  48.25 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  48.25 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  48.25 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  45.93 
 
 		 159 aa  120  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  46.67 
 
 		 159 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  46.97 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  46.04 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  43.88 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  45.31 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  45.65 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  42.97 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  40.94 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  33.86 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  33.88 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  32.35 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  34.92 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  36.36 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  37.8 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  38.33 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  38.33 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  40.62 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  35.77 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  33.86 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  35.45 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  30.16 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  32.31 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 		 144 aa  62  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  34.17 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  35.04 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  33.59 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  35.54 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  33.07 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 		 149 aa  60.1  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  32.5 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  32.5 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  32.59 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  35.65 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  30.47 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  32.5 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  31.2 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  31.45 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  31.78 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0117  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>