288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0190 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
146 aa  293  4e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  48.57 
 
 
184 aa  135  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  50.36 
 
 
176 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  45.26 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  51.26 
 
 
179 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  52.1 
 
 
179 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  51.67 
 
 
189 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  44.14 
 
 
182 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  45.99 
 
 
193 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  44.53 
 
 
182 aa  124  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  46.72 
 
 
182 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  48.74 
 
 
158 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  46.04 
 
 
176 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  46.04 
 
 
176 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  49.59 
 
 
139 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  49.17 
 
 
187 aa  120  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  43.45 
 
 
204 aa  120  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  44.52 
 
 
189 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  56.19 
 
 
169 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  46.1 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  45.26 
 
 
183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  50 
 
 
169 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  41.3 
 
 
161 aa  110  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  44.6 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  42.45 
 
 
225 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 
181 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 
232 aa  101  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  37.96 
 
 
147 aa  100  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  39.01 
 
 
191 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  41.01 
 
 
167 aa  99.8  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 
174 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 
170 aa  98.2  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  45.69 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 
191 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  36.76 
 
 
209 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  38.41 
 
 
160 aa  95.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 
165 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  35.25 
 
 
142 aa  92  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  43.22 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  42.37 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  43.8 
 
 
155 aa  92  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  43.22 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  42.37 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 
179 aa  90.5  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  37.41 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  41.48 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  36.69 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  40.74 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  38.85 
 
 
145 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  38.13 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  38.85 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  38.13 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  38.13 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  38.13 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  36.5 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  38.13 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  33.58 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  35.34 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  41.44 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  41.44 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  41.44 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  41.44 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  41.44 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  41.44 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  35.97 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  40.54 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  39.17 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  35.54 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  38.13 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  32.06 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  39.05 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  32.06 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  37.27 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  38.6 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  34.59 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  37.4 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  36.04 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
138 aa  58.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  36.04 
 
 
139 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  35.04 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0284  thioesterase superfamily protein  32.98 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.719156  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  32.79 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  29.91 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  32.77 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  35.04 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
154 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>