177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0708 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
153 aa  315  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  46.31 
 
 
160 aa  158  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  39.01 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3376  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
125 aa  90.5  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  31.09 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  33.33 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  29.41 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
183 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  29.41 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  30.97 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 
189 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  29.41 
 
 
187 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  30.43 
 
 
185 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  28.93 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  30.83 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  26.85 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
232 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  26.71 
 
 
176 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  26.71 
 
 
176 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  30.43 
 
 
182 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  33.01 
 
 
149 aa  53.9  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  33.03 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  30.6 
 
 
179 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05295  hypothetical protein  34.48 
 
 
136 aa  51.2  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702585  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  27.64 
 
 
191 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  24.37 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  24.37 
 
 
165 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 
182 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  32.94 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  26.21 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2725  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  32.43 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  30.43 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 
162 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  23.91 
 
 
225 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  30.19 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  28.43 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
161 aa  48.1  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  30.11 
 
 
157 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 
191 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  28.26 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
184 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  29.03 
 
 
140 aa  47.4  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  25.42 
 
 
193 aa  47.4  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  25.64 
 
 
153 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  26.14 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  32.95 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  27.73 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  32.04 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  30.1 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  32.04 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  32.04 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  24.14 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  24.14 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0759  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  30.11 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  27.36 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  31.52 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  25 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  31.18 
 
 
211 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  19.53 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 
204 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  28.15 
 
 
162 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  26.42 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  26.42 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  23.28 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1895  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
129 aa  44.3  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  27.34 
 
 
132 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_9084  predicted protein  33.68 
 
 
106 aa  44.3  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>