160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3278 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 144 aa  289  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  99.31 
 
 		 144 aa  288  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  68.06 
 
 		 165 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  68.06 
 
 		 145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  65.97 
 
 		 144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  68.06 
 
 		 145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  65.97 
 
 		 144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  65.28 
 
 		 144 aa  198  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  67.36 
 
 		 145 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  68.06 
 
 		 145 aa  196  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  68.06 
 
 		 145 aa  196  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  65.28 
 
 		 144 aa  196  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  65.28 
 
 		 145 aa  194  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  63.89 
 
 		 145 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  61.11 
 
 		 147 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  67.36 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  60.71 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  67.36 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  67.36 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  67.36 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  67.36 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  67.36 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  66.67 
 
 		 145 aa  180  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  77.27 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  55.24 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  52.78 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  44.53 
 
 		 187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  45.59 
 
 		 182 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  46.21 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  44.76 
 
 		 182 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  45.59 
 
 		 204 aa  118  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  43.06 
 
 		 182 aa  117  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  42.65 
 
 		 185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  44.06 
 
 		 189 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  43.15 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  41.91 
 
 		 193 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  41.61 
 
 		 179 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  39.42 
 
 		 189 aa  103  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  39.86 
 
 		 176 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  39.86 
 
 		 176 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  38.13 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  37.59 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  38.35 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  42.55 
 
 		 184 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  42.22 
 
 		 176 aa  100  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  41.01 
 
 		 169 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  39.86 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 183 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  38.69 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  31.91 
 
 		 160 aa  94  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  36.69 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  37.41 
 
 		 170 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 		 174 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  34.75 
 
 		 191 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  38.69 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  34.27 
 
 		 225 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  37.12 
 
 		 181 aa  87  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  40.74 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  32.85 
 
 		 158 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  32.12 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  32.85 
 
 		 191 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  33.58 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  34.29 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  34.29 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  35.71 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.46 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  29.31 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  34.29 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  34.07 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  35.42 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  32.58 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  34.38 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  34.38 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  34.38 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  36.19 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  29.2 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  35.16 
 
 		 160 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  29.36 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  29.37 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 135 aa  50.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  37.63 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  29.2 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  24.64 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  34.44 
 
 		 160 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>