287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10860 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  331  2e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  38.46 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  36.88 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  38.94 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  32.52 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  36.07 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  31.67 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  31.54 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  33.61 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  33.61 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
138 aa  70.5  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  32.14 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  30.63 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  30.63 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  32.43 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  30.63 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  30.63 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  30.63 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  30.83 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  34.17 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  34.34 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  30.63 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  33.01 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  32.43 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  28.26 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  29.73 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  34.58 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 
176 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
136 aa  63.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  34.21 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  29.17 
 
 
193 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  34.02 
 
 
179 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  33.93 
 
 
147 aa  62.4  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  34.69 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  32.56 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
225 aa  62  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  34.78 
 
 
146 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
170 aa  60.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  32.52 
 
 
155 aa  60.8  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
139 aa  60.8  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  30.48 
 
 
169 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 
165 aa  60.5  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  30.97 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  27.82 
 
 
185 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  33.7 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
136 aa  58.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 
174 aa  58.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  30.17 
 
 
148 aa  58.2  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  28.57 
 
 
136 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
232 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
137 aa  57  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0432  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 
182 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  27.54 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  30.86 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  26.12 
 
 
182 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
149 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  27.82 
 
 
187 aa  54.7  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  28.77 
 
 
181 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  28.7 
 
 
136 aa  54.3  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 
159 aa  54.3  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 
139 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 
204 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
139 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.99 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117185  normal  0.261303 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  31.5 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 
135 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  37.33 
 
 
182 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 
135 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
138 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 
136 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3484  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
135 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  28.7 
 
 
132 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  32.46 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>