197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1868 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  289  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  67.61 
 
 
144 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  67.61 
 
 
144 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  66.9 
 
 
144 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  67.86 
 
 
144 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  61.43 
 
 
144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  60.71 
 
 
144 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  60 
 
 
145 aa  181  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  60 
 
 
145 aa  181  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  57.86 
 
 
147 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  59.71 
 
 
145 aa  180  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  60 
 
 
145 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  58.57 
 
 
145 aa  178  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  60.43 
 
 
165 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  58.45 
 
 
146 aa  177  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  59.29 
 
 
145 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  58.57 
 
 
145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  56.43 
 
 
145 aa  168  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  56.43 
 
 
145 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  56.43 
 
 
145 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  56.43 
 
 
145 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  56.43 
 
 
145 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  56.43 
 
 
145 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  55.71 
 
 
145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  55.71 
 
 
145 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  50.91 
 
 
182 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  41.55 
 
 
191 aa  123  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 
204 aa  120  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  40.88 
 
 
182 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  41.13 
 
 
189 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  39.86 
 
 
185 aa  115  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  37.59 
 
 
155 aa  113  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  36.88 
 
 
167 aa  113  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  40.58 
 
 
187 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
225 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  39.86 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  40.15 
 
 
193 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  39.01 
 
 
170 aa  110  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  38.57 
 
 
184 aa  110  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 
182 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  36.09 
 
 
139 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  38.19 
 
 
159 aa  107  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 
183 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  34.48 
 
 
179 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  34.78 
 
 
179 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 
189 aa  104  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  34.29 
 
 
160 aa  103  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  35.97 
 
 
176 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  35.97 
 
 
176 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  36.17 
 
 
156 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
158 aa  100  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 
176 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  34.75 
 
 
169 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  35.92 
 
 
161 aa  97.1  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  32.61 
 
 
158 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  32.61 
 
 
158 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
169 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  35.46 
 
 
174 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 
146 aa  92  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 
181 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 
232 aa  84.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  40.19 
 
 
135 aa  82  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  40.19 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  35.17 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  32.35 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  35.11 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  34.06 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  32.84 
 
 
209 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  32.14 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  30.84 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  36.89 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 
179 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 
133 aa  57  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  25.52 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  27.1 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  32.63 
 
 
161 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0284  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.719156  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1780  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 
181 aa  52  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  24.44 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  28.93 
 
 
163 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 
159 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  28.32 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  29.9 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2725  thioesterase superfamily protein  28.43 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  28.93 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  31.91 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  28.18 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>