214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4446 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 160 aa  330  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  46.31 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  40.43 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3376  thioesterase superfamily protein  37.39 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  38.14 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  30.34 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  37.27 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  29.45 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  33.9 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  32.54 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  29.06 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  28.1 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  28.71 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  29.46 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  31.25 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  32.77 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  30.69 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2725  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  30 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  27.1 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  34.26 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  29.13 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  27.21 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  23.91 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  29.69 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  24.22 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  23.66 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  26.49 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  25.36 
 
 		 225 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  26.49 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  33.67 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  28.04 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  28 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 		 145 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 135 aa  51.6  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  24.35 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  22.7 
 
 		 148 aa  50.8  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  32.65 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  32.65 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  32.65 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  29.89 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  32.65 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  29.89 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  32.65 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  33.7 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  24.35 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  32.65 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  25.22 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  32.65 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.55 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  32.65 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  32.65 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  22.81 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  25.83 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  32.95 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_9084  predicted protein  31.58 
 
 		 106 aa  49.7  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  26.5 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  28.8 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  29.66 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  32.95 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  26.13 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  25 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  31.63 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  31.63 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  26.55 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  25.47 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>