211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0315 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 187 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  78.52 
 
 		 139 aa  230  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  57.99 
 
 		 189 aa  207  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  55.87 
 
 		 182 aa  206  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  53.93 
 
 		 185 aa  205  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  53.11 
 
 		 182 aa  200  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  52.51 
 
 		 204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  53.25 
 
 		 193 aa  192  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  51.76 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  51.15 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  48.84 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  51.53 
 
 		 179 aa  175  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  45.86 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  46.1 
 
 		 169 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  47.26 
 
 		 183 aa  141  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  47.3 
 
 		 184 aa  141  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  46.48 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  47.14 
 
 		 181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  47.97 
 
 		 155 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  46.05 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  41.72 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  44.37 
 
 		 170 aa  130  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  48.57 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  43.48 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  45.77 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  44.53 
 
 		 144 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  44.53 
 
 		 144 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  38.78 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  39.76 
 
 		 176 aa  120  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  49.17 
 
 		 146 aa  120  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  39.76 
 
 		 176 aa  120  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  43.42 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  41.45 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  42.76 
 
 		 158 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  44.53 
 
 		 145 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  45.26 
 
 		 145 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  45.26 
 
 		 165 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  45.26 
 
 		 145 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  44.93 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  45.26 
 
 		 145 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  44.53 
 
 		 145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  35.92 
 
 		 147 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  43.8 
 
 		 145 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  39.86 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  40.58 
 
 		 142 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  43.07 
 
 		 145 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  38.41 
 
 		 144 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  38.41 
 
 		 144 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  38.41 
 
 		 144 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  38.41 
 
 		 144 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  41.84 
 
 		 232 aa  108  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  41.38 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  40.82 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  43.28 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  39.72 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  45.95 
 
 		 148 aa  104  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  43.07 
 
 		 145 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  40.3 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  43.07 
 
 		 145 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  43.07 
 
 		 145 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  43.07 
 
 		 145 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  43.07 
 
 		 145 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  42.34 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  42.96 
 
 		 145 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 		 179 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  46.88 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  35.57 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  34.68 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  32.88 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  35.14 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  31.65 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  34.86 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  31.68 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  29.01 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  33.64 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  29.6 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  35.83 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  39 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  29.21 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  36.08 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  27.82 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 138 aa  54.3  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 		 151 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 139 aa  53.9  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  39.08 
 
 		 128 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 161 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0829  hypothetical protein  27.41 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  36.44 
 
 		 135 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  30.89 
 
 		 137 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  29.93 
 
 		 148 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  31.76 
 
 		 135 aa  51.6  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 159 aa  51.6  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 149 aa  51.2  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  35.9 
 
 		 147 aa  51.2  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>