153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3308 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  61.81 
 
 		 144 aa  201  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  61.81 
 
 		 144 aa  201  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  61.11 
 
 		 144 aa  200  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  61.11 
 
 		 144 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  63.12 
 
 		 145 aa  193  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  61.11 
 
 		 144 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  61.11 
 
 		 144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  60.69 
 
 		 165 aa  184  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  60.69 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  63.89 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  60 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  60 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  60 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  60 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  59.31 
 
 		 145 aa  181  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  57.86 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  63.19 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  63.19 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  63.19 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  63.19 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  63.19 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  63.19 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  62.5 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  48.97 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  59.46 
 
 		 182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  43.36 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  41.26 
 
 		 185 aa  131  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  42.66 
 
 		 182 aa  130  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  41.55 
 
 		 204 aa  130  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  42.28 
 
 		 193 aa  128  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 		 182 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 189 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  41.96 
 
 		 179 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  42.86 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  38.73 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  40 
 
 		 189 aa  120  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  35.92 
 
 		 187 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  41.55 
 
 		 184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  37.76 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  35.46 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  36.43 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  38.03 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  33.8 
 
 		 169 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  37.41 
 
 		 176 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  37.41 
 
 		 176 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 176 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 		 146 aa  100  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  33.1 
 
 		 158 aa  98.6  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  32.39 
 
 		 170 aa  98.6  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  34.27 
 
 		 225 aa  97.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  34.51 
 
 		 191 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 		 159 aa  96.7  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  31.47 
 
 		 160 aa  94.7  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 		 181 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  31.97 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  35.21 
 
 		 174 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  30.28 
 
 		 158 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  30.28 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 232 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  32.65 
 
 		 209 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  34.59 
 
 		 165 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  31.06 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  33.93 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  30.23 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  30.09 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  31.43 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  29.2 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  30.51 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  24.44 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  29.2 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  29.2 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  31.43 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  28.32 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  26.4 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  31.58 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  31.3 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  25.45 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  27.43 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  27.43 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  27.43 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  27.43 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  27.43 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  27.43 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  27.43 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  26.85 
 
 		 137 aa  50.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>