233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1292 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 159 aa  323  6e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  41.18 
 
 		 135 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  41.18 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  45.3 
 
 		 161 aa  97.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  39.52 
 
 		 140 aa  92.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  39.39 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  38.06 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4877  thioesterase superfamily protein  39.25 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  37.31 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  41.53 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  34.59 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2042  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1683  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.083684  normal  0.174772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  38.39 
 
 		 140 aa  67  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  34.35 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  34.31 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  35.29 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  35.92 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  35.92 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  32.62 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  32.62 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  32.62 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  38.55 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  32.62 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  36.9 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  32.23 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  37.14 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  36.56 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  36.36 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  35.16 
 
 		 191 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  33.09 
 
 		 209 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  33.61 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  32.35 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  36.89 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  29.55 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  36.27 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  27.7 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  29.63 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  29.32 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 		 225 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  31.9 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  36.19 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  36.19 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  35.24 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  36.19 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  32.52 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  33.64 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  36.36 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 145 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  37.5 
 
 		 187 aa  51.6  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 		 134 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  29.92 
 
 		 134 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  37.23 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  31 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  32.32 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  30.71 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  39.77 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  29.76 
 
 		 138 aa  50.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  32.67 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  29.76 
 
 		 138 aa  50.8  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  26.55 
 
 		 137 aa  50.8  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 164 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  34.34 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 128 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  33.64 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  37 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  29.92 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  34.34 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  29.92 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  34.34 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  29.92 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  29.92 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>