134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1683 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1683  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 154 aa  318  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.083684  normal  0.174772 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  35.29 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  36.54 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  36.54 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  39.78 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.01 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  32.69 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  30.09 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  27.47 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  34.78 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  32.23 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  25.69 
 
 		 209 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  27.88 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 232 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  29.31 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  22.94 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  31.18 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  27.5 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2042  hypothetical protein  30.85 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  28.7 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  25.55 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  29.73 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  27 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  28.28 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  31.48 
 
 		 176 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  24.3 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  36.78 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  32.38 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  35.63 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  35.63 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  35.63 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  35.63 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  26.72 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  28.44 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  30.48 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  26.85 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  34.48 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  26.85 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  24.77 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  32.94 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  35.37 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  28.44 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  27.1 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  35.37 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  27.52 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  26.42 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  28.44 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  26.42 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  23.53 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  24.06 
 
 		 160 aa  43.9  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  22.95 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  35.63 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  26.13 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  35.63 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  26.13 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  22.64 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  35.63 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  26.61 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  25.45 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  26.61 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  26.13 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  35.63 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  35.63 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  26.13 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  35.63 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  26.13 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  35.63 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  26.13 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  26.13 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  35.63 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  32.53 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343495 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>