170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0131 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  283  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  99.29 
 
 
140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  89.39 
 
 
142 aa  244  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  42.11 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  42.86 
 
 
159 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  42.86 
 
 
159 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
159 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  42.86 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  38.17 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  42.02 
 
 
159 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  41.75 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  39.84 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 
161 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  39.84 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  39.84 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  40 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  39.84 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  39.84 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  39.84 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  39.84 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  39.84 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  38.84 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  41.88 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  38.46 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  42.24 
 
 
137 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  39.02 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  43.1 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  40.38 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  40.86 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  40.86 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  43.62 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  40.86 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  38.33 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  37.86 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  39.78 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  38.3 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 
144 aa  62  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  37.5 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
160 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  40.43 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  34.19 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  37.7 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  36.15 
 
 
183 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  37.4 
 
 
185 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  35.4 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  34.96 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
232 aa  53.9  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
165 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  40.96 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  39.32 
 
 
181 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  32.8 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 
159 aa  52  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
138 aa  52  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 
176 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  38.55 
 
 
161 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 
159 aa  51.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  37.78 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  37.78 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  33.33 
 
 
238 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  34.17 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  34.17 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  38.64 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  34.17 
 
 
147 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  30.65 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  27.82 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  30.25 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  33.33 
 
 
374 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  29.84 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  31.67 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  29.58 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  27.43 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>