More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4670 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 137 aa  270  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  70.68 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  72.13 
 
 		 144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  45.22 
 
 		 160 aa  99.4  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  46.96 
 
 		 161 aa  99.4  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  42.19 
 
 		 148 aa  99.4  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  41.41 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  45.22 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  45.22 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  45.22 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  45.22 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  43.9 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  44.35 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  43.9 
 
 		 135 aa  97.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  45.22 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  45.22 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  45.22 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  44.26 
 
 		 165 aa  97.1  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  43.48 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  43.48 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  43.48 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  40.46 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  45.22 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  43.44 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  40.46 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  41.22 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  43.48 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  42.15 
 
 		 146 aa  94.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  43.7 
 
 		 154 aa  94.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  43.48 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  40.62 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  42.61 
 
 		 159 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  41.8 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  40.77 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  41.94 
 
 		 149 aa  87  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  40.77 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  41.22 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  39.32 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 		 160 aa  80.1  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  42.24 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  42.24 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  41.51 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  37.59 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  33.06 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  41.96 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  35.4 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  39.23 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  32.26 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  45.35 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  34.96 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  33.9 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0117  thioesterase superfamily protein  39.62 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  34 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  39.58 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  38.61 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  33.33 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  40.45 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  38.6 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  41.75 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  33.61 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  41.94 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  32.46 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  33.83 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  34.82 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  34.91 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1701  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000649367  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  43.18 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  40.19 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  31.65 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  40.45 
 
 		 225 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  33.06 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  33.6 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  34.38 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>