164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1947 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 148 aa  305  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  54.84 
 
 		 133 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  54.03 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  32.23 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  34.75 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  27.2 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  30.4 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  27.64 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  31.4 
 
 		 154 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0117  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  30.61 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1824  thioesterase superfamily protein  39.53 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.177937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  27.61 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  27.61 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  31.78 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  27.61 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  27.61 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  27.61 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  27.61 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  27.61 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  28.71 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  27.2 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  28.71 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  36.76 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  30.41 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  27.05 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  28.33 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  36.76 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  28.95 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  28.91 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  31.96 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  27.7 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  28.21 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  26.87 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  26.19 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  37.5 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  27.91 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  36.73 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  26.19 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  26.19 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  28.46 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  27.91 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  23.88 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  30.58 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  26.12 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  34.62 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  27.64 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  26.4 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  26.4 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  25.78 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  22.39 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  22.39 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  22.39 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  32.2 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  25.6 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  26.67 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  23.88 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  27.69 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  25.6 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  23.88 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  23.88 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  24.43 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  25.6 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  29.52 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  23.2 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  23.2 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  28.57 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  35.65 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  24.81 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>