236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4310 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
149 aa  300  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
149 aa  300  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  80 
 
 
169 aa  244  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  78.72 
 
 
145 aa  231  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  63.38 
 
 
185 aa  204  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  68.75 
 
 
151 aa  204  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  63.38 
 
 
151 aa  203  8e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  63.38 
 
 
151 aa  202  9e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  53.62 
 
 
152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  48.98 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  43.07 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  46.92 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  40.88 
 
 
148 aa  123  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  45.11 
 
 
153 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  39.71 
 
 
162 aa  115  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  44.36 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  40.41 
 
 
150 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  43.8 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  34.72 
 
 
148 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  43.44 
 
 
132 aa  105  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  36.69 
 
 
146 aa  103  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  40.62 
 
 
155 aa  103  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  37.78 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  38.17 
 
 
153 aa  99.4  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  35.07 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  37.5 
 
 
129 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  34.45 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  32.37 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  36.54 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  40.86 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  34.97 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  31.43 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  40.82 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  27.86 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  31.3 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  27.54 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  30.83 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  30 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  28.33 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  28.24 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0264  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0140955  normal  0.333225 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  29.17 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  31.58 
 
 
143 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
159 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  28.33 
 
 
159 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  28.33 
 
 
159 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  27.5 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  29.2 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  29.2 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  29.2 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  30.47 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  26.02 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  27.5 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  27.5 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  27.5 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  27.5 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  27.5 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  27.5 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  27.5 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  30.77 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  34.44 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  28.18 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  29.51 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  32.31 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  32.31 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  32.31 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  28.18 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
165 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  28.68 
 
 
127 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1719  Uncharacterized protein possibly involved in aromatic compounds catabolism  32.53 
 
 
107 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 
155 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  24.63 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  28.35 
 
 
161 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  28.33 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 
126 aa  50.4  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  30.58 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  27.13 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  26.55 
 
 
238 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  28.72 
 
 
191 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  30.53 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>