203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3591 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  314  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  99.35 
 
 
154 aa  313  5e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  97.4 
 
 
154 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  98.7 
 
 
154 aa  309  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  94.81 
 
 
154 aa  304  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  96.1 
 
 
154 aa  303  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  96.1 
 
 
154 aa  303  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  96.1 
 
 
154 aa  303  6e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  94.16 
 
 
154 aa  300  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  88.31 
 
 
154 aa  286  8e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  85.71 
 
 
154 aa  283  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  84.42 
 
 
154 aa  275  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  84.42 
 
 
154 aa  275  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  82.47 
 
 
154 aa  273  7e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  81.17 
 
 
154 aa  270  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  50.32 
 
 
155 aa  159  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  48.7 
 
 
156 aa  158  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.338214 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  47.74 
 
 
155 aa  156  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  47.74 
 
 
155 aa  156  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  47.74 
 
 
161 aa  156  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  47.74 
 
 
155 aa  156  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  47.74 
 
 
161 aa  156  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  49.03 
 
 
155 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  47.74 
 
 
155 aa  156  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  49.03 
 
 
155 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  49.03 
 
 
155 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  49.03 
 
 
155 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  49.03 
 
 
155 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  47.74 
 
 
155 aa  156  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  47.74 
 
 
155 aa  156  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  47.1 
 
 
161 aa  154  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  47.1 
 
 
155 aa  147  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  46.71 
 
 
156 aa  144  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  46.71 
 
 
156 aa  144  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  46.71 
 
 
156 aa  144  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  50 
 
 
157 aa  138  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  44.52 
 
 
156 aa  138  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  46.58 
 
 
162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  45.21 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  46.94 
 
 
157 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0240  hypothetical protein  44.22 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.368257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  46.85 
 
 
157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  38.26 
 
 
160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  38.26 
 
 
160 aa  114  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  36.24 
 
 
162 aa  110  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  41.83 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  38.51 
 
 
163 aa  107  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  38.26 
 
 
162 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  37.5 
 
 
163 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  38.26 
 
 
188 aa  101  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  34.67 
 
 
169 aa  95.5  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  32.91 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  32.87 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  28.08 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  36.17 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  31.82 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2882  thioesterase superfamily protein  33.11 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  30.08 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
154 aa  60.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  30.08 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  22.78 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  27.69 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  27.07 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
137 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  30 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  31.72 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  29.01 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  25.53 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  29.37 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  26.14 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  24.14 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
166 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  28.79 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  23.68 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  25.47 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  31.06 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  32.87 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  24.53 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  25.47 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  23.03 
 
 
233 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  28.67 
 
 
173 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  27.1 
 
 
162 aa  47.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  25.38 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  24.43 
 
 
304 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  36.84 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  28.57 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  23.87 
 
 
140 aa  47  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  23.66 
 
 
295 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  25.38 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  25.98 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>