216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0134 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 
159 aa  319  8e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  52.31 
 
 
152 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  50.76 
 
 
148 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  47.33 
 
 
162 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  50.76 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  45.58 
 
 
185 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  48.91 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  46.53 
 
 
151 aa  128  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  51.97 
 
 
151 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  46.43 
 
 
148 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  45.83 
 
 
151 aa  127  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  47.86 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  46.15 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  46.92 
 
 
149 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  46.92 
 
 
149 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  49.22 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  52.03 
 
 
153 aa  123  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  51.26 
 
 
132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  48.09 
 
 
169 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  48.09 
 
 
146 aa  114  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  44.27 
 
 
150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  48.09 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  45.74 
 
 
136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  48.33 
 
 
129 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  46.22 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  43.15 
 
 
154 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  48.46 
 
 
147 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  46.83 
 
 
155 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  47.83 
 
 
138 aa  100  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  48.33 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  42.74 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  42.61 
 
 
163 aa  92  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  44.25 
 
 
166 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  43.59 
 
 
213 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  40.18 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  38.67 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  39.25 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  39.25 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  46.74 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  40.35 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  40.94 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  40.35 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  40.35 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  40.94 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  40.35 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  38.74 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  39.2 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  34.35 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  38.05 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  48.91 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  36.11 
 
 
141 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 
152 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  34.48 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  35.38 
 
 
238 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  36.29 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  36.29 
 
 
177 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  36.29 
 
 
177 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  36.29 
 
 
177 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  35.34 
 
 
248 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  35.34 
 
 
374 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4384  hypothetical protein  41.59 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.359887  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.88 
 
 
153 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2042  aromatic catabolism protein-like protein  35.09 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.689399 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  37.37 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  37.37 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 
137 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  37.37 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  35.29 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  37.37 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  37.37 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  35.29 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  37.37 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  37.37 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  38.95 
 
 
160 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 
149 aa  58.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
159 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  34.45 
 
 
159 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  35.29 
 
 
161 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  34.45 
 
 
159 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  30.17 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 
148 aa  54.3  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  34.91 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  31.4 
 
 
138 aa  52  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.33 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  28.68 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  30 
 
 
142 aa  51.2  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  36.13 
 
 
160 aa  51.2  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  31.54 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>