229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5037 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  100 
 
 		 146 aa  298  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  76.06 
 
 		 148 aa  224  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  72.11 
 
 		 148 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  73.91 
 
 		 153 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  69.86 
 
 		 153 aa  209  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  78.4 
 
 		 132 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  64.58 
 
 		 155 aa  188  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  46.58 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  48.91 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  43.57 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  43.57 
 
 		 185 aa  123  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  43.66 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  44.9 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  40.29 
 
 		 153 aa  110  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  42.52 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  45.19 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  40.29 
 
 		 169 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  39.44 
 
 		 150 aa  106  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  34.75 
 
 		 145 aa  105  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  36.69 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  36.69 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  49.15 
 
 		 124 aa  103  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  44.35 
 
 		 129 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  42.02 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  39.57 
 
 		 146 aa  99.4  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  40.44 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  39.85 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  41.94 
 
 		 138 aa  93.6  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  39.42 
 
 		 213 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 		 163 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  41.01 
 
 		 136 aa  87  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  36.64 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  39.06 
 
 		 166 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  41.94 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  37.3 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  35.88 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  33.59 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  35.61 
 
 		 238 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  33.59 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  33.59 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  35.61 
 
 		 177 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  35.61 
 
 		 177 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  35.61 
 
 		 177 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  35.61 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  35.46 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  35.61 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  35.61 
 
 		 374 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  39 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  31.21 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  51.85 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  38.71 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  48.15 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.11 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2042  aromatic catabolism protein-like protein  37.12 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689399 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  43.02 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  39.73 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  35.05 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 181 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2124  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4384  hypothetical protein  38.1 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.359887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  33.67 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  31.03 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  38.67 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  44 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  35.87 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 		 232 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  39.77 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  46.88 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  38.2 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  39.36 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  34.41 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  37.33 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  39.13 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 176 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  37.33 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  36.17 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  34.48 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  38.67 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  30.23 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  30.23 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  30.23 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  31.36 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  32.97 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  36.96 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>