211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0175 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
142 aa  289  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  89.39 
 
 
140 aa  244  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  88.64 
 
 
140 aa  242  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  38.02 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  40.16 
 
 
165 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  44.62 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  45.69 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  41.88 
 
 
159 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  41.88 
 
 
159 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  41.88 
 
 
159 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  41.88 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  41.88 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  41.88 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  39.23 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  41.03 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  41.03 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  44.32 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  46.81 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  38.46 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  38.46 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  38.46 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  38.46 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  38.46 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  38.46 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  38.46 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  38.46 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  38.46 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  43.62 
 
 
148 aa  76.6  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  39.06 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 
154 aa  73.6  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  39.78 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  41.94 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  39.78 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  41.94 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  38.71 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  39.36 
 
 
137 aa  67  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 
160 aa  67  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  38.54 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  39.32 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  38.05 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  41.49 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  37.29 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  38.71 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  37.7 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  38.71 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 
183 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 
176 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  37.7 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  35.2 
 
 
232 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
165 aa  53.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5298  phenylacetic acid degradation-related protein  32.62 
 
 
147 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52092  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  32.77 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
138 aa  52.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 
159 aa  52.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  32.03 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
135 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  31.97 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  39.33 
 
 
193 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  36.56 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
157 aa  50.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  38.55 
 
 
161 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  35.87 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  33.33 
 
 
238 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  31.62 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  32.5 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  29.84 
 
 
133 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  32.2 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2248  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 
138 aa  48.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  33.33 
 
 
374 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  31.36 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  36.73 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  34.75 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 
169 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  32.52 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>