More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5946 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  259  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  96.12 
 
 
129 aa  253  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  70.69 
 
 
127 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  70.69 
 
 
127 aa  174  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  69.11 
 
 
127 aa  173  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  66.93 
 
 
127 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  68.29 
 
 
127 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  68.29 
 
 
127 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  68.64 
 
 
127 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  62.93 
 
 
128 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  54.24 
 
 
127 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  42.57 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  34.48 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  32.06 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  32.82 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  32.06 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  40.66 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  32.06 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  38.79 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0264  thioesterase superfamily protein  37.86 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0140955  normal  0.333225 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  36.28 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  36.27 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  40.18 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  34.78 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  33.61 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  33.61 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  33.61 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
159 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  37.19 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  33.33 
 
 
143 aa  62  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  33.61 
 
 
159 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  41.18 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  29.75 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  35.2 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  35.2 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  35.2 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  35.2 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  35.2 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  30.89 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  35.2 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  35.2 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  28.93 
 
 
126 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  28.93 
 
 
126 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  28.93 
 
 
126 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  28.93 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  28.93 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 
161 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  35.96 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  28.93 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  28.93 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
161 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  34.45 
 
 
161 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  31.9 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  33.85 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  35.83 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  35.83 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  35.83 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  37.37 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  35.83 
 
 
238 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  35.83 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1079  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  35.83 
 
 
374 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  35.83 
 
 
248 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
147 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  37.37 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 
146 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
150 aa  57  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30 
 
 
153 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  32.46 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  36.36 
 
 
176 aa  55.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  30.89 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  34.48 
 
 
158 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  39.53 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>