170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3424 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
144 aa  286  6e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  84.4 
 
 
145 aa  241  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  58.04 
 
 
149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  59.06 
 
 
144 aa  154  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 
137 aa  97.4  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  41.8 
 
 
137 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  38.4 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  40.98 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  37.1 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  40.98 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  36.89 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  39.17 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  37.7 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  36.03 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  35.83 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  35.83 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  34.43 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  35.83 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  35.83 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  35.83 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  35.83 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  35.83 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
157 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  31.88 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  35 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  34.17 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  34.17 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  36.89 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  33.61 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  34.17 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  33.9 
 
 
165 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  34.35 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  36.21 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0117  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 
155 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  36 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  34.92 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  35.34 
 
 
140 aa  62  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 
154 aa  62  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 
140 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
139 aa  60.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  32.8 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  34.15 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  29.82 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  34.65 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  35.79 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  33.33 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  33.33 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  33.33 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  33.33 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  33.33 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 
136 aa  57  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  28.95 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  31.09 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
154 aa  53.5  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  29.66 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  31.71 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  27.64 
 
 
209 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  31.71 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  31.71 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  36.56 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  29.73 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  32 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  27.14 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  32.79 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11565  hypothetical protein  32.5 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
134 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
134 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  30.89 
 
 
134 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  35.19 
 
 
147 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 
232 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
165 aa  50.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  33.73 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  29.06 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  28.3 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>