237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2918 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 154 aa  318  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  64.54 
 
 		 146 aa  189  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  63.64 
 
 		 149 aa  187  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  62.5 
 
 		 143 aa  186  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  61.9 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  63.7 
 
 		 137 aa  174  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  61.9 
 
 		 148 aa  170  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  57.35 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  58.78 
 
 		 135 aa  166  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  58.59 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  50.34 
 
 		 176 aa  130  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  49.25 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  45.39 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  48.51 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  47.9 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  47.58 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  45.38 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  45.38 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  45.38 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  45.38 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  45.38 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  45.38 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  45.38 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  45.38 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  45.97 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  45.97 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  45.97 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  45.16 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  45.97 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  45.97 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  43.55 
 
 		 144 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  45.97 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  49.19 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  42.19 
 
 		 144 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 		 137 aa  96.3  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  43.22 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  36.5 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  37.4 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  35.34 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  30.3 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  36.13 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  33.1 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  41.94 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  39.78 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  39.78 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  33.61 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 232 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  29.41 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  33.06 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  31.34 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  34.4 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  28.97 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  31.58 
 
 		 158 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  30.58 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  24.22 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  28.68 
 
 		 209 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  32.63 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  33.05 
 
 		 193 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  34.75 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  33.04 
 
 		 182 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 		 213 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  26.77 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  25.42 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  30.51 
 
 		 127 aa  50.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  32.48 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  32.48 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 204 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>