More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1001 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 137 aa  277  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  73.02 
 
 		 146 aa  184  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  43.2 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  38.66 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  36.51 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  38.58 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  41.94 
 
 		 160 aa  97.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  41.94 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  41.94 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  41.94 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  41.94 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  41.94 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  41.94 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  41.94 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  38.66 
 
 		 146 aa  94.4  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  41.03 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  35.16 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  41.03 
 
 		 159 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  41.03 
 
 		 159 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  41.03 
 
 		 159 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 135 aa  94  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  40.17 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  41.03 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  38.52 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  38.6 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  41.03 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 		 160 aa  90.1  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  34.43 
 
 		 149 aa  89.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  35.48 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  39.84 
 
 		 176 aa  88.2  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 154 aa  86.7  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  37.3 
 
 		 157 aa  86.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  41.23 
 
 		 161 aa  84.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  35.43 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  32.5 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  35.29 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.77 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 181 aa  70.1  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  37 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  33.04 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  29.51 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  34 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  33.04 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  27.05 
 
 		 155 aa  62  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  30.7 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  30.1 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  30.1 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  36.04 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  29.91 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  27.55 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  30.97 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  31.72 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  29.06 
 
 		 161 aa  57  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 179 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  30.33 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  32.41 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  27.64 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  31.72 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  30.07 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  30.97 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0117  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  31.72 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  32.37 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  30.56 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>