More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1737 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 131 aa  275  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  44.62 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2351  hypothetical protein  45.11 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00694587  normal  0.0126121 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  45.28 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  39.66 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1645  phenylacetic acid degradation protein  32.8 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1701  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000649367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  33.62 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1470  hypothetical protein  33.9 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966701  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2248  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.9 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20340  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1555  phenylacetic acid degradation-related protein  30.89 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000594632  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.53 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.15 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.59 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1371  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.34 
 
 		 145 aa  67  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.52 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  35.78 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0902  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.82 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.64 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  40.45 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3366  phenylacetic acid degradation protein PaaD  46.81 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0432  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  37.93 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.86 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.78 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0439  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.36 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  30.77 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.27 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0937  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.18 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  38.74 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  32.38 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  38.74 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04930  hypothetical protein  36.73 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  33.93 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  38.61 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.38 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.48 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1510  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.13 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1977  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.64 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1299  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.54 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  37.61 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.23 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  38.74 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.23 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.14 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  38.37 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.71 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  36.27 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3549  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.71 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0916225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  36.63 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  32.71 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  32.71 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  34.71 
 
 		 251 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  32.71 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  32.71 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  32.71 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  32.71 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  32.71 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.14 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.62 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  34.23 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0512  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.7 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245476  normal  0.787837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  33.68 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  32.71 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0273  thioesterase superfamily protein  35.35 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0676249  normal  0.122372 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  30.63 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  30.63 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  30.63 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2854  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.86 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0283833  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  33.68 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2565  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.78 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  29.73 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0540  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.78 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460721  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  30.16 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1448  hypothetical protein  42.71 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.043674  normal  0.0181319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.27 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117185  normal  0.261303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3246  hypothetical protein  31.58 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>