186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0273 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0273  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 116 aa  235  1e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0676249  normal  0.122372 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0432  thioesterase superfamily protein  50.89 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  46.9 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0297  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.25 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  43.36 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  36.28 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  39.32 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.81 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.05 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.83 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  38.94 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.7 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  36.89 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.55 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.62 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.66 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117185  normal  0.261303 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1977  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.89 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  35.92 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2565  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.92 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0540  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.92 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460721  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.92 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0512  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.92 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245476  normal  0.787837 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.89 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.89 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.89 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.92 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1448  hypothetical protein  40.35 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.043674  normal  0.0181319 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5041  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.56 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0445  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.95 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.02 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.02 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.02 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.02 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3549  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.92 
 
 		 158 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0916225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.92 
 
 		 158 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  35.92 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2854  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.92 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0283833  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0470  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.95 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3627  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.98 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0218071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1645  phenylacetic acid degradation protein  32.74 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0439  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.66 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.03 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.03 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1555  phenylacetic acid degradation-related protein  32.74 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000594632  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.27 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.03 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1079  thioesterase superfamily protein  39.6 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.25 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.63 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.08 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.13 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1660  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388826  normal  0.270829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0373  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000506078  hitchhiker  0.00000423415 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.78 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1470  hypothetical protein  31.86 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966701  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0937  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.29 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  32.74 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  35.35 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1510  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.53 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269892  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.82 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3366  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.73 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3825  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.41 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.478257 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3943  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  34.31 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3098  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.28 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278086 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0637  hypothetical protein  34.48 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0764989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0657  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.1 
 
 		 143 aa  52  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20340  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.19 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0934  hypothetical protein  34.48 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  29.91 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  28.97 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2248  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  30.36 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1371  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154408  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  35.63 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539.1  hypothetical protein  32.97 
 
 		 159 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0622463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.37 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 134 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 		 183 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2476  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.01 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  30.56 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0902  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.23 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  30.63 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2351  hypothetical protein  33.05 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00694587  normal  0.0126121 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1780  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  30.36 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.18 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>