153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1977 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1977  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 140 aa  290  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  47.14 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  48.06 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  40.94 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2351  hypothetical protein  44.72 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00694587  normal  0.0126121 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1470  hypothetical protein  36.07 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966701  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2248  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 		 138 aa  90.5  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1555  phenylacetic acid degradation-related protein  35.71 
 
 		 135 aa  84  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000594632  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.21 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  33.82 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.92 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.89 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1645  phenylacetic acid degradation protein  31.75 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.09 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0937  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.15 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.36 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1701  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000649367  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0902  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.62 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.74 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0439  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.62 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.74 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.74 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.74 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  30.16 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.5 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1371  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.68 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154408  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.93 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2476  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.64 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.55 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.55 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.77 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1510  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.35 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269892  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0273  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0676249  normal  0.122372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3098  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278086 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2890  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0373  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.21 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000506078  hitchhiker  0.00000423415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20340  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.27 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  32.43 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  30.23 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  29.2 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3825  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.23 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.478257 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0432  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3366  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.85 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.79 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.77 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  33.33 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.09 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05295  hypothetical protein  29.92 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702585  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.08 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3047  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.75 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.84 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  28.68 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0223  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.103741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0445  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.84 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2854  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.36 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0283833  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  29.84 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.47 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0512  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.91 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245476  normal  0.787837 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0470  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.84 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2565  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.91 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.84 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0540  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.91 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460721  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1660  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.61 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388826  normal  0.270829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3943  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.36 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3627  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.46 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0218071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5041  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.34 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.77 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.36 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117185  normal  0.261303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2404  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.12 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.671288 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  25.38 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3246  hypothetical protein  25.83 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3549  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.84 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0916225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.84 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  26.26 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  30.84 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.46 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.66 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3719  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.670455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2696  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.71 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165626  hitchhiker  0.00035972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2481  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.41 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000323431  hitchhiker  0.00762361 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26560  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.07 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1079  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.57 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  28.99 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.13 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0657  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.59 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  27.73 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.17 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>