269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1553 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 146 aa  295  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1660  phenylacetic acid degradation protein PaaD  47.41 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388826  normal  0.270829 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  46.81 
 
 		 251 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  46.81 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3549  phenylacetic acid degradation protein PaaD  46.81 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0916225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  46.1 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  44.78 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  44.03 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  45.52 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  43.88 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  48.36 
 
 		 178 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  47.41 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3098  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.25 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  44.19 
 
 		 146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  46.34 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0657  phenylacetic acid degradation protein PaaD  43.65 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  45.11 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05295  hypothetical protein  41.41 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702585  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2404  phenylacetic acid degradation protein PaaD  44.03 
 
 		 150 aa  105  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.671288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  45.9 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  43.41 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.91 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.79 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3943  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.01 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.86 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2854  phenylacetic acid degradation protein PaaD  44.19 
 
 		 152 aa  103  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0283833  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0373  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.93 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000506078  hitchhiker  0.00000423415 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0512  phenylacetic acid degradation protein PaaD  44.96 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245476  normal  0.787837 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2565  phenylacetic acid degradation protein PaaD  44.19 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0540  phenylacetic acid degradation protein PaaD  44.19 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460721  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.86 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3627  phenylacetic acid degradation protein PaaD  44.96 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0218071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3825  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.41 
 
 		 141 aa  100  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.478257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0470  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.85 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.6 
 
 		 146 aa  100  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0439  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.3 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0445  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.85 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.11 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  45.53 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.15 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  41.22 
 
 		 150 aa  97.1  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2481  phenylacetic acid degradation protein PaaD  50 
 
 		 160 aa  95.9  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000323431  hitchhiker  0.00762361 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.76 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.76 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.76 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  39.2 
 
 		 137 aa  94.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.76 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.23 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1510  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.37 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269892  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  45 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.06 
 
 		 153 aa  92  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2696  phenylacetic acid degradation protein PaaD  45.31 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165626  hitchhiker  0.00035972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  45.61 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  49.52 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3246  hypothetical protein  45.13 
 
 		 172 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 		 130 aa  90.1  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.62 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  39.37 
 
 		 147 aa  89.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3366  phenylacetic acid degradation protein PaaD  45.38 
 
 		 154 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.06 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0937  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.88 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3047  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.98 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0902  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.26 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0223  thioesterase superfamily protein  37.98 
 
 		 158 aa  87.8  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.103741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2476  phenylacetic acid degradation protein PaaD  44 
 
 		 135 aa  87  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1701  thioesterase superfamily protein  37.8 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000649367  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1555  phenylacetic acid degradation-related protein  35.66 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000594632  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.24 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2890  thioesterase superfamily protein  40.8 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.5 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539.1  hypothetical protein  45.63 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0622463  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26560  phenylacetic acid degradation protein PaaD  44.76 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  44.04 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2248  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  35.61 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1470  hypothetical protein  34.68 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966701  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  42.48 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  42.48 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1371  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.24 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154408  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0934  hypothetical protein  44.79 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1645  phenylacetic acid degradation protein  36.64 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1977  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5041  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.88 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0637  hypothetical protein  43.75 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0764989  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.96 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117185  normal  0.261303 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20340  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.17 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  31.25 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2351  hypothetical protein  42.97 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00694587  normal  0.0126121 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  29.69 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  30.16 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0432  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21410  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.56 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01900  hypothetical protein  36.28 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  38.14 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3719  thioesterase superfamily protein  41.53 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.670455 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  27.52 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>