More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0152 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
134 aa  276  9e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  39.39 
 
 
161 aa  111  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  36.22 
 
 
143 aa  96.7  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  34.68 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2725  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  29.85 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  36.72 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  35.71 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  31.45 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  36.29 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  34.31 
 
 
193 aa  63.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  33.33 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  30.28 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  35.71 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  37 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  35.35 
 
 
182 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  29.69 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
145 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  32.62 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  30 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
170 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
144 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  31.34 
 
 
165 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  34.34 
 
 
182 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  31.75 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
140 aa  60.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  32.08 
 
 
136 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.25 
 
 
155 aa  60.5  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34 
 
 
146 aa  60.5  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
146 aa  60.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  33 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  34 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0439  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  34 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  34 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.75 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  37.62 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  30.95 
 
 
135 aa  58.2  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  33 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  34 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  33 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  29.69 
 
 
166 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  33 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 
146 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  32.23 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  34 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.42 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  34 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  30.93 
 
 
163 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5041  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.93 
 
 
153 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  34 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  32.63 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  34 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  34 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  34 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  30.16 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 
158 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  34 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  33.91 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1977  thioesterase superfamily protein  26.26 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
204 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  31.53 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  34.02 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
189 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3376  thioesterase superfamily protein  30.68 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>