More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2542 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 146 aa  300  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  91.67 
 
 		 154 aa  270  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  62.79 
 
 		 147 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  63.57 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  59.69 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  62.4 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  55.73 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  49.23 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0328  thioesterase superfamily protein  46.4 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  34.75 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  37.7 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  37.7 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  37.7 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  38.46 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  31 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  37.36 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  37.36 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  31.93 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  37.36 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  37.36 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  36.26 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  36.26 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  36.26 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  36.26 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  36.26 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  36.26 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  36.26 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  35.16 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  32.26 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  29.75 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  26.4 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  32.11 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  32.04 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  35.92 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  32.11 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  28 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  32.11 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  38.37 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  31.53 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  29.13 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  29.57 
 
 		 129 aa  57  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  29.41 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  33.98 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0530  ComA2 family protein  29.41 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184702  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  33.7 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  31.19 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  28.21 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  31.19 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  27.88 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  28.97 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  27.35 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  27.35 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  28.7 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  24.8 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  32.29 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  29.52 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  27.35 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  28.18 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  28.15 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  24.8 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  24.41 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2351  hypothetical protein  38.83 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00694587  normal  0.0126121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  27.1 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  24.8 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  29.52 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  28.72 
 
 		 233 aa  53.9  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  27.01 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  32.98 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  32.5 
 
 		 163 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  33.67 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  24 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  32.67 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  30.28 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  32.5 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2476  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.83 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  30.51 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 		 170 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  26.72 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>