More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1130 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  100 
 
 		 143 aa  293  5e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  36.22 
 
 		 134 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  34.59 
 
 		 139 aa  94  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  32.03 
 
 		 161 aa  86.7  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2725  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.76 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  30.08 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  30.61 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  27.78 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  28.15 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  34 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  28.46 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  36.44 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  37 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5041  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.08 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  33.65 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.03 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  34.62 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  33.65 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  33.65 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  33.65 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  27.35 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  34.75 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  34.69 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  28.93 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  32.69 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.62 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  37.35 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  32.2 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.07 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.65 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0297  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.64 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  35.92 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0902  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.34 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  36.26 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  33.94 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  33.94 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  33.94 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  33.94 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  39.56 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  33.94 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  33.94 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  33.94 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  34.83 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  32.56 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05295  hypothetical protein  27.59 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702585  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  31.78 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  28.95 
 
 		 140 aa  57  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.03 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.4 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  32.95 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  35.79 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  33.66 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  29.37 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  27.36 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  29.66 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  36.26 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  33.71 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1660  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.36 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388826  normal  0.270829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  31.36 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  36.89 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  34.17 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  34.17 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  26.42 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>