104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2975 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 153 aa  321  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 		 135 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  41.98 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  40.5 
 
 		 160 aa  87  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 		 162 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 		 173 aa  84  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  34.68 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  30.6 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  34.06 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  30.83 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  41.53 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  32.59 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  26.72 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  31.29 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  30.6 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  37.35 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  29.46 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  42.05 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  32.79 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  25.37 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  39.77 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225846 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  30.58 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  31.82 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  32.12 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  32.94 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  40 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  36.73 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  36.73 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  36.73 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  36.73 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  32.79 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  33.33 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 		 127 aa  48.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  35.71 
 
 		 160 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  35.71 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  35.71 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  35.71 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  35.71 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  35.71 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  35.71 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  35.71 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  30.93 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  36.46 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  39.56 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  32.29 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  31.46 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  32.18 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  30.53 
 
 		 319 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  31.31 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  31.25 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  36.99 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  29.7 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  27.55 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  30.11 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0484171 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>