118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2272 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 141 aa  291  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  64.06 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  57.04 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  61.24 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  58.14 
 
 		 137 aa  158  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  50.75 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  39.04 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  41.04 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  40.3 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  36.72 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  36.07 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  35.94 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  33.62 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  33.83 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  32.79 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  26.55 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  25.66 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  24.82 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  34.44 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  26.71 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  31.2 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  31.2 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  31.2 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  31.2 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  31.2 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  31.2 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  31.2 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  30.08 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  30.08 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  31.96 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225846 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  30.4 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  28.46 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  28.46 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  26.83 
 
 		 319 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  36.99 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  31.68 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  29.21 
 
 		 304 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20340  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.48 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  29 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  26.83 
 
 		 295 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  34.09 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  30.39 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10738  PaaI_thioesterase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04355)  34.52 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00650285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  27.37 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  31.5 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  32.22 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  33.71 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  24.63 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  35.53 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2323  phenylacetic acid degradation-related protein  32.58 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  28.42 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  26.02 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  27.82 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1824  thioesterase superfamily protein  28.43 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.177937  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  27.96 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  26.09 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>