69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5402 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  330  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  71.43 
 
 		 173 aa  236  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  75.69 
 
 		 162 aa  234  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  69.93 
 
 		 173 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  70.13 
 
 		 162 aa  223  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  52.48 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  53.68 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 		 147 aa  137  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  47.79 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  41.3 
 
 		 144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  40.3 
 
 		 144 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  37.18 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 		 144 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  40.5 
 
 		 153 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  40.77 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2323  phenylacetic acid degradation-related protein  32.5 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  37.78 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2233  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  39.09 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1303  thioesterase superfamily protein  32.59 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  38.18 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  34.88 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  27.34 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  30.71 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  36.26 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  31.45 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  30.33 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  33.82 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  32.82 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 178 aa  43.9  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225846 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04930  hypothetical protein  38.46 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2481  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.71 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000323431  hitchhiker  0.00762361 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10738  PaaI_thioesterase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04355)  28.32 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00650285 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  39.19 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 151 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3799  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.254263  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 161 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  35.63 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.25 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 248 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  23.28 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  26.92 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 		 128 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  35.87 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0297  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 123 aa  41.2  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  26.88 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.48 
 
 		 124 aa  40.4  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>