54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1750 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 173 aa  360  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  84.57 
 
 		 173 aa  293  8e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  85.19 
 
 		 162 aa  289  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  78.4 
 
 		 162 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  69.93 
 
 		 160 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  55.47 
 
 		 140 aa  150  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  51.8 
 
 		 149 aa  148  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  43.05 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  44.76 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  40.44 
 
 		 144 aa  98.2  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  37.21 
 
 		 144 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  37.21 
 
 		 144 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 		 144 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  36.92 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2323  phenylacetic acid degradation-related protein  32.39 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  36.72 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  36.79 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1303  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  32.81 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  30.1 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2233  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 121 aa  53.9  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  34.86 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  33.94 
 
 		 134 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 		 156 aa  51.2  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  32.97 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  33.71 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04930  hypothetical protein  38.81 
 
 		 145 aa  42  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 		 248 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  32.35 
 
 		 128 aa  42  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  31.03 
 
 		 160 aa  42  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 134 aa  40.8  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  33.78 
 
 		 149 aa  40.8  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  31.03 
 
 		 160 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  31.03 
 
 		 160 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  31.03 
 
 		 160 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  31.03 
 
 		 160 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  31.03 
 
 		 160 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  31.03 
 
 		 160 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  31.03 
 
 		 160 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>