64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1075 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 147 aa  303  8.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  52.59 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  53.33 
 
 		 149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  45.77 
 
 		 144 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  46.81 
 
 		 162 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  44.76 
 
 		 173 aa  121  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  44.76 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  47.37 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  44.93 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  42.19 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  38.13 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  38.13 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  42.19 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  39.2 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  32 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  30.82 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1303  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2323  phenylacetic acid degradation-related protein  30.56 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  31.01 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2233  thioesterase superfamily protein  34.74 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  25.87 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  28.68 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  31.76 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  36.78 
 
 		 178 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225846 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  30.65 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  37.93 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  27.56 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  30.83 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  30.51 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  24 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  29.92 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  37.65 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  27.13 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  30.77 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  28.68 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 160 aa  43.5  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  29.52 
 
 		 140 aa  42  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  33.33 
 
 		 187 aa  42  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 139 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  30.65 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>