199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2286 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
137 aa  283  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  81.02 
 
 
137 aa  221  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  41.6 
 
 
140 aa  103  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  40.8 
 
 
139 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
142 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  36.8 
 
 
141 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
139 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  37.12 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  31.93 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  34.45 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  32.35 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
135 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  41.75 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  31.93 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  30.63 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
179 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  31.09 
 
 
124 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
173 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  32 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  32.95 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  30.58 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
173 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  30.83 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  36.47 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  34.34 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2725  thioesterase superfamily protein  29.47 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
147 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 
182 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 
144 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 
144 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 
144 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
127 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  34.78 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 
144 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  29.17 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  33.67 
 
 
161 aa  50.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  39.47 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  29.17 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  36.05 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  35.71 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  33.08 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  30 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  36.23 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  39.47 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  41.11 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  30.85 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  36.56 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  36.56 
 
 
191 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  32.31 
 
 
160 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  32.31 
 
 
160 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  32.29 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  32.31 
 
 
160 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  32.31 
 
 
160 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  32.31 
 
 
160 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  32.31 
 
 
160 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  32.31 
 
 
160 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  32.5 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  36.96 
 
 
145 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  32.5 
 
 
159 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  32.5 
 
 
159 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
159 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  34.88 
 
 
144 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  32.5 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  35.87 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  34.88 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.807912 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>