77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2234 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 144 aa  302  9.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  45.77 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  46.56 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  41.3 
 
 		 160 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  41.09 
 
 		 153 aa  104  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  40.44 
 
 		 173 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  36.88 
 
 		 162 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 		 162 aa  95.9  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 		 173 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  40.46 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  32.59 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  34.75 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2323  phenylacetic acid degradation-related protein  37.11 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  30 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  36.26 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2233  thioesterase superfamily protein  29.52 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  34.74 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1303  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 139 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  29.67 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  32.63 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  28.85 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  29.17 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  35.14 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  38.46 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  28.69 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  30.21 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 154 aa  43.5  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  28.21 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  29.9 
 
 		 148 aa  42.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  26.73 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  37.66 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  28.21 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  37.66 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  29.52 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  37.66 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  37.66 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  36.49 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  36.49 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  36.49 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  36.49 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  36.49 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  36.49 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  36.49 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  30.23 
 
 		 143 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  36.49 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  29.09 
 
 		 154 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  23.74 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  24.39 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  31.33 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  36.36 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  28.7 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  31.46 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  28.57 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  35.21 
 
 		 148 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  35.21 
 
 		 148 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>